Affymetrix Canine Genome 2.0 Array 狗
该芯片可以检测18,000个犬的mRNA/EST转录子，和超过20,000个非冗余的预测基因。
Agilent棉花寡聚DNA芯片（4×44K）
棉花全基因组表达谱芯片所用的序列信息来自于RefSeq, UniGene, TIGR Plant TA 和TIGR Gene Indices等知名数据库，代表了43,803个棉花基因和转录本。
illumina 高密度自定义基因芯片
自定义基因芯片根据研究需要任意挑选SNP、甲基化（CpG岛）、基因位点进行基因分型、甲基化水平、基因表达水平研究，其研究对象可以是各种物种，包含疾病，遗传学，功能基因组研究等。
人染色体CGH芯片20号染色体,人CGH染色体芯片
人染色体CGH芯片20号染色体,人CGH染色体芯片Human CGH 385K Chromosome 20 Tiling Array
长链非编码RNA芯片
ncRNA研究的重要一步是发现与特定疾病相关的lncRNA。传统的lncRNA筛选方法（SELEX等）效率低下，假阳性率高。而基因芯片具有覆盖全面、高效、准确的特点
Affymetrix Plasmodium/Anopheles Genome Array 疟原虫
该芯片包括约4,300 Plasmodium falciparum 的转录子和约14,900 Anopheles gambiae 转录子。